巢虫，它对蜂群而言能酿成灭顶之灾，必须严加防治。古人说:“凡事预则立，不预则废”。防治蜜蜂病虫害，也是这样。防治巢虫，一般有以下6种方法，可供养蜂人参考、选用。可按一张脾2克升华硫的量来烟熏使用过的空脾，7天后再熏一次，熏后用塑料布裹住装有这些熏蒸过的蜂脾的蜂箱，将其密闭起来，能存放半年。若空脾多，就用继箱堆4~6层高，一并熏蒸，也同样有效。此法简便、有效、省工，但污染巢脾，影响日后蜂蜜的质量。据测算:若用100克升华硫燃烧熏蒸充满5层继箱的巢脾，它所产生的热量足以熔化其底层的巢脾。幸好升华硫燃烧是缓慢进行的，并非瞬时燃烧，它烧到一半就会自行熄灭。不过，为防止火灾发生，升华硫应放于瓦罐中燃烧，还应有人看管。
将空脾排列放于容器里，灌满干净水浸泡2周，完全可以淹死虫和卵。问题是水中会产生微生物而生异味，于是人们试着在水中加入一些起防腐作用的东西，如分别在水中加入10%的盐、7%的碱、5%的白醋，将脾浸2周后取出摇干水，再放进清水中浸3天，然后再摇干水，吹干脾备用。其结果是:灭虫的效果大致相同，但用醋水浸过的脾繁蜂最快；用盐水浸过的脾繁蜂次之;用碱水浸过的脾繁蜂最差。原因何在?因为蜜蜂是嗜酸性昆虫，酸性残留物不影响其生长。它不适宜在碱性条件下生存，养蜂人的口头禅是:“要得蜂子垮，就去采茶花。”茶花中含有茶碱。至于盐，它是蜜蜂生长所需要的矿物质，用其喂蜂时，其浓度不能超过0.5% 。否则会产生慢性中毒。据蜂农介绍:蜂子采茶花时，可在蜂场加强喂水，在水中加进0.5%食盐和1%的白醋水，能将茶碱对蜂群的危害降到最低限度。
将空脾迎着太阳斜靠墙边晒2~3小时，不时翻面，巢虫耐不住高温爬出巢脾滑落地面。这种办法简便、环保、省钱。主要问题是一些藏于暗处的虫和卵，一次晒不绝，还要晒2~3次。 晒脾时注意:选择有3~ 5级大风的日子。这样既不易熔脾又易于晒死虫卵，还要选择要无蚂蚁的地方晒脾。 冬天把装有空脾的蜂箱放在室外冷冻半个月，可以将病虫害冻灭，减轻次年危害。但要防止雨雪淋箱。有的蜂场，秋天也将抽出的空脾连箱存于冷库。这种方法非常有效、省工、安全，是存脾的最佳选择方案，不过受时间、地点和条件的局限。
将防治巢虫的药喷脾1-2次，以杀死虫卵，但此法污染巢脾。 若巢虫成灾，蜂脾已千孔百疮，那就只有割脾熔蜡，这是杀灭巢虫的最后一招。
